时间将能够提供最佳的证据，来判断西伯利亚岩浆大爆发**是如何造成如此显著的影响的。当维格纳尔和他在中国地质大学的同事们对中国境内发现的537种海洋生物化石进行了细致研究，结果发现其中有92%的种类在此期间遭遇了灭绝的命运。而更加关键的是，他们发现整个灭绝过程是分两个阶段进行的，中间大约存在18万年左右的间隔期。
在第一个阶段，浅水区域生活的生物遭遇了一场浩劫，如珊瑚，以及生活在浅海海床上的一些微型生物，如蜓以及一类名为“放射虫”的浮游生物。而相比之下，在第二个阶段，灭绝**则主要发生在海洋深处。
在经历第一阶段的灭绝**之后，新物种的演化速度是相当迅速的，而在经历第二阶段的灭绝过程之后，整个生物界的复苏过程就显得缓慢许多。这暗示在这一阶段发 生了从根本上动摇整个生态系统的重大环境变化。从格陵兰和南极地区发掘出来的植物化石也同样支持这一观点，即二叠纪末期大灭绝**本身存在着两次相互分开的阶段。这其中最为重要的一点就在于岩浆喷发过程中释放出的巨量温室气体和其他有害气体，包括二氧化碳和二氧化硫等等，这些气体都会导致全球气温的升高。
随着全球气温的升高，海水中溶解氧气的能力将会下降，而在正常机制下能够将氧气向深海区域输送的洋流强度也将随之减弱甚至陷于停滞。这样的缺氧环境一般被认为正是导致海洋生物大量灭绝的主要原因——这一点已经得到从全球各地采集到的属于这一地质时期的岩层证据的支持。
另外一些科学家指出，由于大气中二氧化碳含量的升高，海水中也会溶解更多的二氧化碳成分，而这将造成海水酸化，从而导致贝壳类生物难以形成其碳酸钙质地的外壳。海水中更高的二氧化碳含量也将迫使海洋生物们更努力地吸入氧气，呼出二氧化碳。
当时海水酸化的情况至少延续了超过数万年之久，所有这些**都会影响到海洋生物的正常生存，因为它们会对生物体的氧气摄入和新陈代谢机制产生影响。而在另一方面，全球变暖过程也将对陆地上的生物产生显著影响，不过这种影响显然是不足以解释当时所发生的如此规模的动植物大灭绝**的。目前主流的地质学界倾向于认为这样的死亡灾难是当时大量有毒的氟氯碳类气体，如氯甲烷等被大量排放到大气中所导致的。
科学家们认为这些气体可能是由于西伯利亚地区地下的煤炭和盐层受到上涌岩浆的加热而产生的。这些物质将会造成严重的臭氧层破坏
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