导致了他的失踪。
但是正因为没人知道孙元化到底遇上了什么，这才让主剿一派的人抓住了把柄，这帮人一口咬定，孙元化是畏罪潜逃，虽然他们没有任何证据，只是凭空cāicè，可是让主抚一方的人无法反击的是，他们说孙元化没有潜逃，却也没有任何证据证明。
正好叛军接连又攻克了招远，屠城三日，杀人无算，接着又攻破了平度州，同样也制造了无数血案。
眼瞅着叛军势力越来越大，包括东江镇那边，不少东江军也跟着闹了起来，南北相互呼应，搞得是乱七八糟，可是朝堂上，却还在为到底该剿还是该抚的问题，争执不休，如果再这么下去的话，叛军发展的就会更加肆无忌惮，事态发展的可能更无法收拾。
而且目前看来，叛军肯定不会放过莱州城，强攻莱州只是时间问题，果不其然三月初，叛军在连克招远和平度两地之后，李九成和孔有德再次集结数万叛军，兵抵莱州城下，开始包围莱州城，对莱州发动了猛攻。
新任山东巡抚徐从治和莱州知府朱万年派人再次向朝廷求援，并且率领莱州城守军，据城死守，在莱州城下，和叛军激战不已。
事已至此，崇祯皇帝也终于下定了决心，最终决定对叛军采取进剿的策略，不再kǎolǜ招抚的问题。
因为崇祯现在看来，这一次叛军搞得如此厉害，如果还对其招抚的话，无疑弄不好会造成很不好的影响，甚至可能成为一个很坏的例子，以后要是那些骄兵悍将，稍有不满，就动辄发动兵变，把事情闹大，然后指望朝廷招抚，便屁事没有的话，以后谁还不会这么干？
这么一来，本来就已经糜烂的国事，岂不是更乱了吗？这次的事情，也让崇祯帝对那些主抚一派的人产生了看法，当堂斥责了首辅周延儒等人，彻底压住了主抚的声音。
另外对于另外几个被叛军shìfàng，逃回京师的张焘、宋光兰、王征等人，崇祯下旨，将其全部逮问，关入到了大牢之中。
至此朝廷从叛军起兵反叛，到最终下定决心进剿，已经是快小半年的时间过去了，这对于叛军坐大，无疑提供了相当大的便利。
既然决定进剿，那么朝廷自然是开始kǎolǜ，该调哪儿的兵将前往登莱进剿叛军，现如今朝廷可用的兵力并不是很多，虽然登莱距离关辽一带并不算远，关锦一带的边军还是相当有点战斗力的。
原来天津卫和保定也是有一些兵马的，可是正月间这些兵马，已经在黄县被叛军大败，损失殆尽，
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