再也不敢怠慢，赶紧派人跑到海边打白旗表示接受条件，他愿意率部投降。
于家军海军这才停止了发炮，传令给孔有德，令其下令，全军放下武器，到岸边进行集结，所有叛将离开他们的手下，和孔有德一起，先行被接到船上，其余人等等候接下来的整顿收编。
孔有德无奈之下，只得下令放下武器，所有人到岸边开阔地上集结投降，他和手下把总以上的军将，都离开本队，单独到临时码头哪儿集中起来，被于家军用几条小船接到船上，单独看押了起来，等于是彻底切断了他们和手下兵卒的联系。
兵卒们没了当官的控制，当然就掀不起大浪，何况现在他们早已失去了斗志，老老实实的在岛上等候于家军对他们的收编。
在分开了军将和兵卒的联系之后，海军从船上才送了一批陆军上岸，接管龟岛上的防务，开始对岛上的叛军进行整编。
所有叛军全部被彻底打散，混编成新的连队，当然不是军队的连队，而是俘兵连，只是一个临时编制。
然后这些俘兵们才被船只一批批接上船，运离了龟岛，暂时先运往养马岛或者是胶州湾南部海面上的灵山岛，进行初步检疫和整顿，接下来才会被船只逐步转运回南方。
在获得这么多俘兵的同时，于家军还从俘兵之中，找到了上千的工匠，这些工匠都是当初孙元化想尽办法，从各地弄到登州的，他们之中绝大部分都是铁匠。
这些铁匠奉命在登州城起炉，为孙元化铸炮或者是打造鸟枪抑或是打造甲胄，都算是熟练工，叛军逃离登州的时候，没忘了把这些工匠也强行裹挟一起带走，现如今都便宜给了于孝天了。
另外叛军把这一年来抢劫所获的大批金银财宝，都带出了登州城，事先藏在长岛的那一批财货，已经被于孝天抄走，现在这一批数量更多，单是白银就超出了二十多万两，另外还有黄金或者是黄金首饰器具，也有足足数千两之多，至于玉石玛瑙之类的珠宝，同样也数量巨大。
还有叛军为了维持接下来一段时间的供应，还在出逃的时候，携带了大批的粮食，也够他们吃俩月没问题了。
当然叛军还从登州城，携出了大量的火炮以及鸟铳、单眼铳、三眼铳之类的武器，还有大批刀枪器甲，也同样都成了于孝天的战利品。
单是这批粮食就可以让于孝天减少了为了养活这帮家伙要耗费的粮食，总之这件事干的是干净利索，叛军带出登州城的所有东西，差不多除了随船沉入水中的之外，都成了于孝天的战
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