内部的德军坦克一辆被苏军反坦克炮摧毁，另一辆也被勇敢的苏军士兵用炸药消灭。其他各个堡垒内的苏军也表现出英勇的战斗精神，在没有指挥员的情况下各自奋战，尤其是捷列斯波尔和沃伦城堡内的苏军第一二五步兵团和第八十四步兵团军官训练学校的学员和士兵们，积极主动出击，将德军突击力量大部牵制在中心城堡附近，为中心城堡和北部科布林城堡的苏军赢得了宝贵的时间。这两个城堡内的苏军于六月二十二日上午，在德军还没有完全围困城堡外廓的间隙里，有相当一部分辅助人员和伤员成功撤离城堡，到六月二十二日中午德军完全围困住要塞的时候，留在要塞中坚持战斗的官兵大约还有三千五百～四千人。留下来的人被孤立分割在要塞的四个堡垒内，彼此之间没有联系，整个要塞的守卫者们也没有一个统一的指挥系统，而是靠着各自堡垒内的军官和政治委员们领导着独立的抵抗战斗。
到六月二十二日夜晚，德军占领了捷列斯波尔堡垒和沃伦堡垒的大部分，并通过这两个堡垒连接中心堡垒的桥梁，占据了中心堡垒捷列斯波尔门和霍尔姆门之间的一段营垒。在捷列斯波尔堡垒西部的布列斯特门附近的防御工事里，仍然有大约三百名苏军士兵坚持战斗，与捷列斯波尔堡垒遥遥相对的沃伦堡垒，在战争爆发前是苏军第四集团军和第二十八步兵军的医院，驻扎着苏军第六步兵营和第九十五医务营，还有一个第八十四步兵团的初级指挥员训练学校和少量国境守卫队的士兵，这里残余的守卫者在六月二十二日还有零星人员在坚持战斗。到六月二十二日夜晚，德军在一天艰苦战斗中阵亡了二十一名军官和二百九十名士兵，这大大超出了该师在一九三九年整个波兰战役中的总阵亡数目，可见战斗的激烈程度。
六月二十二日夜晚对留在布列斯特要塞的苏军官兵来说，是一个痛苦的记忆，中心堡垒苏军还保留有电台，尽管他们想尽办法，都不能和上级指挥部取得联系，他们不知道，整个苏联国境线都爆发了大规模战斗，六月二十二日白天从要塞北部耀武扬威地通过的德军装甲集群已经迅速推进到数十公里外的苏联境内，而且锐不可当。而且整个苏军西方面军的联系都是一片混乱，就连莫斯科的苏军总参谋部都无法和西方面军司令部取得联系，就不用说远在国境线的这个小小的部队了。
各个堡垒内留下来的苏军官兵都来自不同的部队，尽管他们彼此之间无法取得联系，他们还是在各自的混合团体中选出了自己的指挥员。有战斗力的混合部队分为三块，他们分别被德军割裂在中心堡垒、科布
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