胡惟庸当了丞相后，飞扬跋扈，独掌生杀大权。他竟敢拆阅呈给皇帝的奏折，径自处理，对不利自己的奏折隐匿不报；他还时常不奏报朱元璋，独断专行官员的生杀升黜大事。他还在朝廷中不断培植私人势力，并拉拢军界。于是他的门下出现了一个文臣武将齐集的小集团。朱元璋为此深感不安，皇权与相权产生了激烈的冲突。洪武十三年，朱元璋以”擅权植党”的罪名杀了左丞相胡惟庸，同时对和胡来往密切的官员也进行抄家灭族。以后又几兴大狱，使”胡惟庸狱”不断牵连扩大，到洪武二十三年，功臣太师李善长等人也以与胡惟庸”交通谋反”被杀。著名儒臣、文学家宋濂只因受孙子连累，全家被贬到四川，他也病死于途中。此案延续了10年之久，前后被杀的几十家王公贵族，共30000多人。这期间若没有锦衣卫的参与，以满朝文武皆是胡惟庸的人，洪武爷纵是再能干，未必能做到将胡惟庸一举剿灭，事实上胡惟庸案从洪武二十三年，洪武爷颁布《昭示奸党录》，以伙同胡惟庸谋不轨罪，处死韩国公李善长、列侯陆仲亨等开国功臣。后又以胡惟庸通倭、通元(北元)，究其党羽，前后牵连人数众多，这些罪证寻找速度，准确，都都锦衣卫的影子在里面，从后来结果看，毛骧制造了胡惟庸死后的牵连大案，最后自己也被洪武爷平息众怒而杀头，正好说明了这一点。
再看蓝玉案，蓝玉是开平王常遇春内弟。有谋略，作战英勇，屡立战功。洪武十四年封永昌侯。二十年拜为大将军，屯蓟州。二十一年捕鱼儿海（今内蒙古东部贝尔湖）之战，杀北元太尉蛮子等，降其众，获马驼牛羊十五万余，焚其甲仗蓄积；又破哈剌章营，获人畜甚多。朱元璋对其宠遇甚隆，封为凉国公。但蓝玉居功自傲，骄横跋扈。他蓄庄奴假子达数千人之多，并仗势侵占民田。北征时私占珍宝驼马无算。回师夜经喜峰关，因守关吏未及时开门，竟纵兵毁关而入。他的所作所为，引起朱元璋不满。洪武二十六年，锦衣卫指挥蒋告发蓝玉谋反，下狱鞫讯后，狱词称同景川侯曹震、鹤庆侯张翼、舳舻侯朱寿、定远侯王弼、东莞伯何荣及吏部尚书詹徽、户部侍郎傅友文等谋反，拟乘朱元璋籍田时发动叛乱。朱元璋遂族诛蓝玉等，并株连蔓引，自公侯伯以至文武官员，被杀者约两万人。该案与胡惟庸案合称为胡蓝之狱，此案与胡惟庸案差不多，处理迅速，罪证来得快，这都说明锦衣卫在背后参与，其与胡惟庸案一样，第二任锦衣卫蒋瓛，蓝玉谋反的罪证就是他秘密禀告洪武爷的，蓝玉案之后也被洪武爷赐死，两案子牵连之大，可谓是前无古人
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