席负责，负责全国行政事务和官员任免；立法和司法则是为了司法独立而设置，和检察院共同构成法律体系；考试院在负责高等教育和全国公务人员选拔考试的同时，还讲负责推义务制教育等内容。
在军事上，国防部成为国民政府最高军事机构，受政府主席直接管辖，领导全国武装力量的建设和国家防务。原先的国民军事委员被撤销，军委会下属各级单位。兵员开始实行义务兵役制，全国被划分了东北、西南、西北、东南、华北、华中、华东几个不同的战区，各级军队也开始进行序列改革。
为了防止国党一党专政，黄柯力主国民政府主席由国民代表大会选举产生，而国民代表其中所有党派党员数量不能超过总数的一半。同时，黄柯还建议出台了国家军人保护法，其中对军人身份做出了明确的规定，不允许军人加入任何党派组织，必须效忠国家。
双方政治力量的博弈自然让黄柯这些诉求得到了应允，不过黄柯还是低估了国党在中央政府的影响力，首届国民代表大会选举的时候，汪精卫依旧是高票当选国民政府主席。
和国府主席相比，五院院长也都分别被一些有声望的人士担任，例如考试院院长蔡元培等人都是比较中立公正的人，双方自然都是满意。
政治博弈上博弈自然会影响到军事上的人事调动，作为双方默契协作的成果，国防部首任部长由西关派蒋先云担任，而国党蒋中正则是当上了陆军部总司令，陈绍宽和许绍周分别任海军、空军总司令。
各大战区的司令官进行了任命，西北战区司令长官的位置给了王茂才，崔武担任华东战区司令官，而东北战区本来是由张学良担任，蒙古、绥远等地就是巴图和刘坚的治理了，西南黄柯派去了李宗仁；相应的，华北、华中两个战区就是国党党派的高级将领担任了。
政治上的力量博弈让双方都还算满意，所以在一段时期内南京国民政府趋于平静，财政部门开始发行法币，整顿金融秩序；军事上也进行集团军改革，推行黄柯建议的机械化。
因为之前进行的全国土地改革，广大农村地区的经济得到了长足的发展，再加上机械设备的推广，宗族势力被外来文化破坏，红党在偏远的农村地区并未形成有效的组织。
失去了群众基础的红党在军事上自然是没有了任何的优势，不过红党在政治上的一些主张和他们中的青年，的确可以做到为国效力。不久之后，黄柯开始通过预备干部处的人和红党进行接触。
黄柯和他们接触最为适合，
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