三次忍界大战，直接击败了砂隐，击退了岩隐和水隐，并且在一定程度上压制了云隐，而且在有第四代火影波风水门的压制之下，木叶就这样还是赢下了第三次忍界。
不过，虽然宇智波一族叛逃了，但在大概木叶四十九年，依旧发生了九尾暴走的事情，而这件事的始作甬者据说是曾经叛逃的宇智波一族的宇智波带土。
波风水门为了保护木叶，便自己牺牲，封印了九尾。
波风水门牺牲之后，本来猿飞日斩想要出来重新执掌木叶，但是却受到不知道什么原因回来的三忍之一纲手的反对，而随着纲手反对的，还有不少的小忍族，毕竟当初猿飞日斩之所以下台，都是因为他们的逼迫。
所以猿飞日斩不得不宣布只是代理火影之位，并且会尽快的选出第五代火影。
虽然猿飞日斩下台了，但是毕竟当了数十年的火影，他的旧部势力依旧极为强大，后来便将他的另一个弟子自来也推上了前台，成为了第五代火影。
身为三忍之一，又经历过二战，三战，在战争之中立下赫赫战功的自来也自然有成为火影的资格。
之前是因为自来也一直懒散，没有权力的欲望，所以才没有参加争夺火影，否则的话，第四代火影绝对不会轮到波风水门，而应该是自来也。
也不知道猿飞日斩怎么说服的自来也，自来也竟然还真的回来继承了第五代火影的职位，同时纲手也回到木叶担任了火影辅佐。
有着两个三忍，拥有真正影级的强者坐镇，再加上猿飞日斩等强者，木叶终于恢复了一些实力，原本见到波风水门死去还有些蠢蠢欲动的云隐顿时安份了下来。
值得一提的是，原本云忍依旧想着用抓日向一族的宗家来试探木叶的实力，结果不同于猿飞日斩的处理方式，自来也直接将这些使团绑了起来，并且致信给云隐的雷影，让他做出选择。
见到木叶依然强势，云忍也不敢有所异动，雷影自然再派使者致信给火影，说这是使用擅自的举动，云隐并没有打算挑起战争，回去之后定当严惩这些使者云云，这才将这些使者接了回去。
而除了这些之外，还有一个需要注意的是，趁着忍界大战脱离的宇智波一族，先是举族逃到了鬼之国，然后在趁着第三次忍界大战之时，吞并了雪之国、幽之国以及熊之国三个国度，建立了一个属于宇智波一族的国度－－智之国。
智之国的制度与忍界其它国度相同，都是一国一村制度，只是不同于其它国度的军政分离，智之国的大
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