山东闻香教案的破获，使朱有孝对自己对新政有了足够的信心，也对继续扩大新式官员的培训加大了力度，他准备今年再次举行考试，继续招收培训新式官员，并且把试验的范围扩大到直隶、河南、陕西、甘肃，以便彻底稳固大明朝在北部的基础。
在辽东的熊廷弼自开春以来一直也没有闲着，自从去年夺取铁岭、同化以来，他一直在囤积粮草和练兵。在军备方面，枪炮弹药不断的在改进，新式的大炮装备了二十多门，迫击炮准备了一百多门，“二踢脚”小炮装备到了各个小队。
按照朱有孝的整军安排，熊廷弼新式的军队全部是募兵制。因为辽东有足够的土地，再加上从直隶和山东不断迁徙过来的老百姓，熊廷弼的兵源没有任何问题，现在已经募集了十万精兵，这十万精兵分别由贺世贤、尤世功、满桂、赵率教、毛文龙各带一万五千人。因为现在的武器还不像后世那么猛烈，就是炮火的覆盖力度还不是太强大，火枪还需要密集的队形进行排射，所以编队方式也不可能像后世的那样精简。熊廷弼手下这几员猛将都包括“二踢脚”小炮兵营二千人，步兵五千人，枪骑兵五千人，后勤兵三千人，平时集中训练，到战事发生时根据实际情况派出兵力。每一个主将下面的这一万五千人又分为三个千户，以千户作为基本的作战单位，既可以单独作战，又可以互相协助作战。
熊廷弼自己则和孙传庭带领其余的二万五千人马，这里面就包括所有的大炮和迫击炮，骑兵全部是一人双马的轻骑兵。因为在辽东真正需要一下子出动十万人马的战事现在并不太多，除非是要想大规模对女真人围剿，所以分散的小围剿比较多，熊廷弼就把这些小战斗当作是实战练兵。
随着明军不断的越来越强，努尔哈赤和科尔沁蒙古人的联系就越来越困难，尤其是叶赫那拉部落和明军联合以后势力更是不断向北发展，逐渐就有了切断他们联系的趋势。努尔哈赤部落还稍好一点，毕竟他的地盘稍大一点，再加上眼看着西边明军不断强大，他就开始向东和北的方向发展，同时和朝鲜开始悄悄的做起了生意。
科尔沁蒙古人的运气可以说是糟透了，在和女真人联合作战时，二万精锐骑兵被孙传庭打得落花流水，几乎全军覆没，好歹孙传庭并没有乘胜进入科尔沁大草原，让他们有了喘口气的机会。不过察哈尔部落的林丹汗却不放过他，林丹汗在明朝的支持下强大起来，通过不断的牛羊脂肪贸易，把废料变成了银子，通过商品垄断贸易控制了其他蒙古部落的粮食、茶叶和其他日常生活用品渠道
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