废尚书令，设尚书左右仆射，黄浩然为左仆射，贾问道为右仆射，管理六部。
三高官官职务明确，中书省依据季玄陵的命令来起草诏书，门下省审核，签署，尚书省执行皇命。
此举三分相权，巩固皇权，三省间既相互牵制，也互为补充。
避免出现一人之下，万人之上的权臣，做到集思广益。
三公改变，九卿随之改变。
负责掌管租税钱谷和财政收支的治粟内史改为户部，贾泰初任户部尚书。
掌管宗庙礼仪的奉常，掌管皇族，宗室的宗正，负责外交的典客，三家合为一体改为礼部，陆世铭任礼部尚书。
掌管司法审判的廷尉改为刑部，廷尉长官徐茂才荣升刑部尚书。
掌管宫廷御马，国家马政的太仆，与管理官府手工业的少府，二合为一改为工部，少府长官范宜法任工部尚书。
凭添兵部，吏部，殷鸿为兵部尚书，从前的御使大夫褚良骥为吏部尚书。
与此御使大夫，散骑侍郎皆有安排，张懿为京兆伊。
对于军队，季玄陵君臣也作出更改。
洛邑城为京师，安排南北两军，南军保卫皇宫，北军拱卫京城牧苍驰，高宗离任南北军统帅。
从前各军称号废除，设神策，神武，龙武，骁武，云骑，飞骑六大主战军团，各军作战精锐十万。
神策，神武两军铁骑为主，轻骑为辅，负责长途奔袭，远程作战打击。龙武，骁武两军皆为步兵，配备各类器械，床弩，火炮，投石器，以攻城拔寨为主。
云骑，飞骑两军皆为轻骑兵，装备长枪，盾牌，长弓，强弩等，进行高机动，连续的作战。
大秦腹地各郡允许招募五千兵勇，维护郡县安危。边疆各郡允许招募两万兵勇，配合边军防御，作战。
诸将内，设四镇将军，分别为前后左右四将，设四征将军，分别为东西南北四将，设卫将军，车骑将军，骠骑将军，大将军。
邬纪灵为骠骑将军，申屠秀为车骑将军，公孙昂为卫将军，三人皆有开府的资格，战争来临时，三人领兵作战。
狄钟康，狄钟泰，陆林轩，林间律为四征将军，郭济康，阮星河，盖文广，段孟臧为四镇将军。
杨经略，冀连凯随柳牧辰训练水师，三人皆为水师都督。
狄钟康，狄钟泰，陆林轩，林间律，郭济康，阮星河统领神策，神武，龙武，骁武，云骑，飞骑，直接听命皇上。
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