1944年夏，美军在太平洋战场的西南和中部取得连续胜利，也让战争步步进逼离日本本土——当时的美军轰炸机已经可以直接轰炸日本了。此时，美军参谋长联席会提出了两种不同的方案来打击日本：一是麦克阿瑟上将提出的先重占菲律宾、再占冲绳并用作为进攻日本本土的跳板；海军上将尼米兹认为应绕过菲律宾、直接攻占冲绳和台湾并用作集合点，同时可成为以后进入中国大陆和攻击日本南端岛屿的跳板。 双方最后吵到联席会议马歇尔那里，麦克阿瑟向马歇尔陈述意见，指出：绕过菲律宾直接进攻台湾是不可取的，台湾不同菲律宾，已经在日本统治下将近半个世纪，当地人未必会像菲律宾人那样支持美军，而且美国在道义上有义务解放1700万亲西方的菲律宾人民和关押在巴丹半岛的数万名美军俘虏。他强调：如果绕过菲律宾就等于承认革命军散布的关于美国已经抛弃菲律宾，不愿牺牲美国士兵的生命来解救菲律宾人民的谣言，这对美国在远东地区的声望和影响将是极其不利的。
马歇尔认为麦克阿瑟这么强烈要求进攻菲律宾的一个重要原因是为了实现他在1942年撤离菲律宾时所许下的一定要重新夺回菲律宾的誓言，因此提醒他，不要让个人感情超越早日结束战争的战略目标，并表示绕过菲律宾并不是抛弃菲律宾。
虽然路线有所不同，但两种方案里都不约而同的出现了贝里琉岛的名字。而美军海军陆战队第1师业已被任命为进攻部队。为了平息分歧，美国总统罗斯福亲自飞赴珍珠港与两位指挥官见面，一同探讨进军方案。罗斯福此行的真正目的是为了在日益临近的大选前夕，笼络被很多美国人认为是英雄的麦克阿瑟，为大选赢取得分。经过与麦克阿瑟上将和尼米兹上将的磋商，最终确定在进攻台湾之前先占领整个菲律宾。罗斯福返回美国之后发表了简短的讲话，宣称与麦克阿瑟将军的意见完全一致。这个信号再明白不过，菲律宾战役为时不远了。但就在麦克阿瑟准备重占菲律宾之前，为了确保右翼的安全，美军决定把帕劳群岛——特别是贝里琉岛和昂奥尔岛——定为必须攻克的战略要点。这种想法在发动贝里琉岛战役之前就遭到很多人的质疑，而后来的一些人甚至认为攻占贝里琉岛完全没有必要。
德军在库尔斯克战役失败的消息传来，日本大本营里一片焦虑，参谋本部里日军海军与陆军将领更是互相指责乱成一团，海陆互相指责一通后，总算又坐了下来，开始研究下一步的行动部署，一致认定，1944年情况下稳定太平洋战线的任务是日本的作战重
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