空白的一个临床科室,是医学遗传科,通过解读患者的基因检测结果,诊断疾病的临床科室。
一个特殊病例恰好体现了一个临床领域的空白所带来的问题。
六个月的宝宝,出现不明原因的中性粒细胞减少,减少程度并不严重,也没有出现反复或严重的感染,且没有其他症状或检查异常。当地医生做了详细的检查,包括“全外显子测序”,结果显示,患者有一个CASP10的基因变异,这个孩子的CASP10有4个外显子全部丢失,预计所产生的蛋白质会没有功能。
已知CASP10变异可以导致一种叫做“自身免疫性淋巴细胞增生综合征的疾病,该病属于常染色体显性遗传病,机制是淋巴细胞凋亡受阻,导致异常的淋巴细胞增生,从而导致自身免疫和淋巴增生表现,包括中性粒细胞减少等。
而已知CASP10是促进细胞凋亡的基因,CASP10的致病变异可以让细胞凋亡过程受阻,导致ALPS这个疾病,而且还是常染色体显性遗传。
这个孩子的CASP10基因4个外显子全部丢失,预计基因功能会完全丧失,诊断ALPS似乎是顺理成章的事情。这也是基因检测报告的意见,国内的大医院医生也是这样认为。
但是,这里却有两点不对劲。
一方面,文献搜索CASP10这四个外显子缺失,发现日本报道了一个家庭,父亲和两个孩子三口都有这四个外显子缺失,却没有一人患上ALPS,而只有一个孩子得了关节炎,里面集合了20万人的基因组数据信息,并且根据这些信息做了很多有意义的分析。
在gnomAD数据库上,我发现CASP10这个基因,人群中有较高比例的人有着预测可以导致功能完全丧失。
意思是说,一个人有两条染色体,每条常染色体上有分别来自父母的一套相同的基因,这上面如果某个基因即使完全失去功能,只要另外一个没问题,对个体健康就不会有影响。
也就是说CASP10这个基因,人群中本来就有不少人(两个基因之一)是完全没有功能的,而这些人完全健康。
所以问题来了,CASP10的致病变异是怎么导致ALPS的,为啥这个病还是常染色体显性遗传病?
继续深入的查了一下文献,原来CASP10的致病变异导致ALPS的机制是dominantnegativeeffect(“显性负效应”),而不是haploinsufficiency(“单
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