现在的故事聚焦于夜袭队中，准确的说是夜袭队a、b、c、d四组之一的a对之中。
这个由队长和仓英辅，副队长西条凪，以及三位队员石堀光彦，平木诗织还有孤门一辉这三人组成的五人小组之中。
往往邪恶总是会隐藏于让人意想不到的地方……
而《奈克瑟斯》奥特曼剧本修改后，里面最大的邪恶，宇宙最凶恶的破坏神黑暗扎基, 便隐藏于夜袭队里面石崛光彦队员的身体上面！
石崛光彦，不，准确的说是山冈一，其人是十八年前时被来到地球的黑暗扎基使用凭依能力强行附身并抹除意识的人类科学家，这些年里面他都是披着人类的马甲，实则是以黑暗扎基的意识在行动着！
黑暗扎基没有完全复活, 作为人类行动的这些年里面, 他一直跟随着蓝星对付异生兽的终极战队夜袭队, 黑暗扎基的人类体作为夜袭队的一员，他与那些队员们一起，经历过千辛万苦击败了无数被他强化过为人类带来痛苦与绝望的异生兽！
同时黑暗扎基也见证了那拥有着他的宿敌诺亚奥特曼一般光之能量的光之巨人奈克瑟斯奥特曼，一次又一次拼死一般的英勇战斗！
对此黑暗扎基的内心充满了戏谑与不屑，那是站在暗处，便可以掌控全局，把一切生物耍的团团转，对自己实力上的绝对自负！
他要让所有人因为他的存在而绝望痛苦！而且他有信心做到这些，至于奈克瑟斯，黑暗扎基笑看着这位强大无比的光，把自己的适合者折磨的不成人样的样子，这对于他来说是每天的保留节目，他对看着人类因为过大的光受到伤害，明明就是凡人，却逞能打扮成英雄的样子，而感到好笑！
对于贩卖绝望与痛苦, 以黑暗能量为食物的黑暗扎基来说，他永远无法理解人类传递光芒的行为, 他永远听不懂, 光是羁绊的力量，人类与奥特战士之间的羁绊究竟是什么……
而巧合的是，在这小小的基地内，还有一个人不屑于这个脆弱的羁绊！
在黑暗扎基凝视黑暗，于黑暗之中找快乐的时刻，黑暗也在凝视黑暗扎基！
作为黑暗宇宙大皇帝的朱庇特，一直潜伏起来，默默地注视着黑暗扎基，在黑暗扎基嘲笑奈克瑟斯的时刻，朱庇特正在嘲笑黑暗扎基。
扎基的保留节目是笑话奈克瑟斯，并思考下一次用什么样子的手段狂虐奈克瑟斯，而朱庇特没一天的保留节目是，看着黑暗扎基布置场景挑选演员，然后被打算陪着他玩玩的
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