武宗已带病回到北京。有关葡萄牙人侵占满剌加、在屯门澳设寨及虏掠小儿的罪行报告也陆续传抵北京，朝廷正展开激烈的讨论。
这时，正在北京的佛朗机使团倚仗江彬颇为嚣张跋扈，引起朝廷大臣的不满和反感。曾任广东顺德县令的监察御史丘道隆及顺德县籍的御史何鳌更大肆声讨葡萄牙人的罪行，因为葡萄牙人还绑架当地人口。
这两位官员又指责首倡“抽分制”的前“广东布政使”吴廷举应负政治责任。礼部经过讨论议决“夷人留驿者，不得往来私通贸易，番舶非当贡年，驱逐远去，勿与抽盘。廷举倡开事端，仍行户部查例停革。”
对此，大病在身而行将驾崩的明武宗则下诏：“悉如议行之”。就这样，托梅·皮雷斯出使中国的任务宣告失败，而自成化以来逐渐形成的“海口贸易”与“抽分制”就因“佛朗机”（葡萄牙殖民者）的干扰而遭废止。
正德十六年三月乙丑(西元1521年4月19日)，明武宗朱厚照驾崩。武宗驾崩，死后无嗣，其生母张太后与内阁首辅杨廷和决定，由近支的皇室即武宗的堂弟朱厚熜继承皇位，为明朝历史上有名的“嘉靖皇帝”。
朱厚熜即位之初，通过大礼议逐步掌握皇权。在位早期，他英明苛察，严以驭官、宽以治民、整顿朝纲、减轻赋役，史称“嘉靖新政”。 但是到了执政后期，他崇信道教、宠宦官信严嵩等人，导致朝政腐败。
由于明世宗多疑暴戾，喜怒无常，侍宫人常被责罚，杖毙者多达二百余人。于是，宫人们终于忍无可忍，就在嘉靖二十一年（西元1542年）一起合力发动了“壬寅宫变”，欲将这个“虐待狂皇帝”杀死以泄愤。
嘉靖二十一年（西元1542年），在王宁嫔等人的指使下，杨金英等十数名宫女乘着嘉靖帝明世宗熟睡之际，用黄绫布把世宗的脖子套住，然后用力拉扯，企图杀死明世宗。而后，又因为那布条打了死结，缢不死世宗，遂又用钗、簪等物刺向皇帝。 在这时，其中一个胆小的宫女因害怕，就偷偷报告给了方皇后。
待方皇后率领随身护卫赶到后，立刻将宫女们制服。最终，涉事宫女全都被凌迟处死，而参与谋逆的曹端妃、王宁嫔等也一并被斩首。对于曹端妃是否被诬陷存在争议。但经过此事后，皇帝老子性情大变。
在嘉靖二十一年（西元1542年）的“壬寅宫变”中，明世宗朱厚熜几乎死于宫女之手， 此后干脆长期不理朝政，反而迷信方士、浪费民力，最终激起民变，让大明王朝在走向衰亡的
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