年），明朝第一次北征鞑靼时，明廷就再次发现了竟然有“兀良哈人”反叛大明并加入了鞑靼军中。
“三卫”如此作为，当然是忍恼了朱棣。于是，在永乐九年（西元1411年），朱棣遣使谴责“三卫”首领并怒斥：“比者尔为本雅失里所胁，掠我边卒，又遣苦列儿给云马市，实行窥伺。狡诈如此，罪奚可容？”
在永乐朝，因明朝军力强盛，而朱棣作为一雄主南征北战，让“兀良哈三卫”即使忍不住时不时反叛一下，但大部分时间还是被迫效忠明朝的，因为他们清楚自己的实力不如“鞑靼”强盛，但后者被明朝击溃。
正因为有了“兀良哈三卫”的存在，才更有利于明廷掌控东北地区。如此一来，朱棣也未想过要彻底灭掉“朵颜三卫”。就在双方都各有所需之下，明廷与“三卫”之间在永乐朝乃至以后得以长期保持着臣属关系。
明廷和“三卫”虽因利益关系得以长期保持着一种相对和平状态，而“三卫”也因依附大明朝廷，使其经济、军事得到了大幅度增长，但在不久后的“正统年间”，随着瓦剌一统蒙古，“三卫”的好日子也就到头了。
当时，瓦剌首领也先（额森）一直有着要再次入主中原恢复“元朝”的雄心壮志。而对于瓦剌部来说，它要想安心地与明廷争夺中原，就必须要先灭掉“兀良哈三卫”这个反复无常的隐藏的威胁才行。
于是，随着瓦剌一统蒙古，“兀良哈三卫”就成了瓦剌瓦剌大军首先要攻灭的第一个障碍。明朝正统十二年（西元1447年），瓦剌部首领也先（额森）率部进攻兀良哈三卫，“泰宁”、“朵颜”二卫被迫投降，而“福余”卫则退回嫩江流域。到了嘉靖年间，残存的“兀良哈三卫”则被蒙古察哈尔部、科尔沁部吞并。
自此，真正的“兀良哈三卫”或曰“朵颜三卫”不复存在，只有那些“鸠占鹊巢”者依旧冒用“朵颜三卫”的名义向明朝进贡草原特产以还回其所需的生活物资，但后来仍被新进崛起的“后金”强行吞并，也无可奈何。
不过，随着“朵颜三卫”或曰“兀良哈蒙古”的大小贵族乃至底层牧民得知明朝在攻灭“后金”后准备扫荡辽东，便都纷纷在第一时间前来投靠，希望能为明朝效力以换取好处。当然了，明朝正好利用他们在大漠草原上散播消息，让之前与“后金”结盟的“科尔沁”部弃暗投明，否则强行攻打，全部杀光！这就是武力恫吓。
当然了，也有不少蒙古部落以前并未与明朝发生过军事冲突的，便赶紧通过自称为“兀良哈
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