会打破该地区军力平衡，危及邻国的安全，日本为此感到担忧。同时提醒清政府，必须遏止雷霆纵队的膨胀，否则也会危及清政府的政权。
京城里朝廷大臣中出现了不和谐的声音。光绪皇帝正在紫禁城内的养心殿批阅奏折时候，一份奏折映入了他的眼帘，上奏折的人是康有为，奏折的内容说，现在许多大臣认为雷霆纵队的兵力庞大，装备精良，战斗力很强。对外已经遭到日本国的抗议。对内，把这样一支大军交给一群没有辫子的人来统帅实在太危险了，会养虎为患，危害清政府的统治。建议将这支部队进行拆分，然后交给忠于朝廷的人来统帅，以保证大清的江山能够长治久安。东三省总督这样重要的职位（东三省总督是清政府八个权力最大的地方官员之一）也不能让一个没有辫子的人来担任。但考虑到目前唐峰并没有给朝廷带来危害，且在抵御日本进攻辽东的时候颇有功绩，建议让其担任俸禄较高但没有实权的职位。
看完之后，光绪帝心里也疑惑不安起来：对呀，康有为说的有道理，雷霆纵队虽然打败了日本人，把日本人赶出东北，朝廷得到了安宁，但是，雷霆纵队在战后发展很快，不断壮大，到现在已经成为一支不可小觑的军队。震慑了日本国的侵略野心，当然会引起日本国的抗议。但是确实要避免养虎为患啊！有必要遏制雷霆纵队的膨胀势头，或者想办法把唐峰雷霆纵队司令职务换掉。于是，光绪帝一面把这件事情报告给慈禧太后，让慈禧太后拿主意，一面召集恭亲王奕䜣、翁同龢、荣禄等，自己认为可靠的大臣一起商讨此事。最后大家一致的意见是免去唐峰雷霆纵队司令的职务，任命唐峰为礼部尚书（这是一个掌管祭祀、宗教之类事务的官职，没有实权）。雷霆纵队的其他主要军官也被分别调往其他部队任职，雷霆纵队则被拆分成两个部分，一部分调进关内，由荣禄统帅，一部分留在东北，由袁世凯统帅。东三省总督一职由袁世凯继任。
议定之后，光绪帝召见了袁世凯和山海关总兵（山海关清军的最高指挥官）熊铁生，让他们做好准备，以备不测。随后任命康有为为钦差大臣，前往雷霆纵队传达命令。
光绪帝频繁的召见自己信得过的大臣，却没有召见李鸿章，这引起了在《雷霆日报》驻京城联络处特工的警觉，但是由于清政府采取了保密措施，特工们并没有得到太多的情报，虽然情报很少，但是特工们还是非常慎重的把得到的情报整理之后用加密电报发给了部队。
沈梦熙拿到电报之后，立即送到唐峰办公室，说：“司令员！大事不
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