最终导致西迁的林丹汗因感染天花的缘故病死于青海地区。
战胜林丹汗后，建奴基本控制住了敖汉部、奈曼、内喀尔喀、喀喇沁、科尔沁等部，之后阿鲁科尔沁部长达赉楚琥尔、四子部落台吉伊尔扎布墨尔根台吉、阿鲁伊苏特部台吉齐桑达尔汉、噶尔玛伊勒登等各率所部先后也归顺了皇太极。
再之后，在皇太极强大的军力下，巴林、翁牛特、阿苏特等部也投靠了过去，此时建奴的实力达到了顶峰，可以说大半个蒙古都在建奴的掌控之中，或者成为了皇太极的同盟部落。
假如没有朱慎锥的话，皇太极接下来压制蒙古各部，征服整个漠南蒙古仅只是时间的问题，可惜正因为朱慎锥的出现，使得土默特草原成了皇太极征服漠南蒙古的绊脚石，在出兵土默特，意图完全征服整个漠南蒙古的时候，建奴却碰了个头破血流，随着多尔衮兄弟在土默特一仗被击败，建奴西进的势头被遏制，而土默特也就此成为了漠南蒙古唯一正面战胜建奴的存在。
随着之后的局势发生变化，皇太极先后在长城之战和后来的锦州之战中无功而返，再随着大明对辽东战略的一系列调整和经济、军事双重的封锁，建奴的军事力量开始逐步走了下坡路。
等到这个时候，土默特这边在大明的扶持下不断壮大，其势力逐步向东延伸，通过几次战争压制住了察哈尔西部地区，再到后来由阿古达木领兵正式进入察哈尔，步步蚕食，把那些原本依附建奴的察哈尔各部收复，最终联合明军展开反攻，不仅打下了整个察哈尔地区，还直接攻进了科尔沁、内喀尔喀蒙古，这时候大明也在辽东发动战役，一举击败所谓的大清，攻破盛京（沈阳），强盛一时的建奴就此灰飞烟灭。
在这期间，腾格尔还在西边协助漠西蒙古各部打赢了对漠北蒙古的战争，朝克图台吉在此战中阵亡，漠北蒙古各部大败。
之后腾格尔多次向漠北蒙古用兵，打服了漠北蒙古各部，使得大半个漠北蒙古已落入土默特的统治范围，由此一来，整个蒙古草原局势大变，和以前完全不同了。
大明的军事力量空前强大，对蒙古的震慑力也不同往日。再加上传闻中腾格尔兄弟和大明皇帝的关系，这些不得不让蒙古各部承认大明对蒙古的影响力和宗主的身份。
腾格尔兄弟的存在更让蒙古各部无法忽视，现在可以说整个蒙古腾格尔兄弟的实力最大，尤其是腾格尔本人更成为了林丹汗之后有资格号召蒙古各部的强大力量。
再加上阿古达木占据察哈尔，前不久又
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