东南之地，唐、鲁并立，使得天有二日，国有二主，然而隆武登基在前，鲁王监国于后，按法理，鲁王理应退位归藩，使南明至少在名义上实现统一，但无奈隆武帝血统太过疏远，而朱以海黄袍加身，想要退下也不情愿，何况拥立他的大臣，也不愿放弃“定策”之功，担心入隆武朝后不受重用，随使得唐、鲁逐渐对立。
中华自古以来，绝不允许国有二主的局面，浙东鲁王政权中，大臣们随即分为两派。
大学士朱大典、督师钱肃乐、大将方国安等人为一派，他们都认为，“大敌当前，若同姓先争，岂能成中兴之业？且圣子神孙，总为祖宗疆土，今隆武既正大统，自难改易，若我监国，犹可降心以相从。”
他们认为，就眼下形式来看，隆武帝已经登基，自然不可能退位，而隆武朝廷已经得到了南方绝大多数的南明势力的承认，而鲁监国只凭浙东一隅与之相抗，乃极为不智之举，所以他们赞成闽浙联合，接受隆武朝廷的正统地位，劝鲁王接受皇太侄之称，去监国之位，以免浙东独树一帜，孤立无援。
可是，国舅张国俊，大将王之仁等人的另一派却坚决反对，俱认为，“主上原无利天下之意，唐藩亦无坐登大宝之理。”
他们主张“先复金陵者为王”，甚至还有人说出“凭江数十万众，何难回戈相向”的话语，不惜动武争夺帝位。
唐、鲁之争，使闽浙对立，但因此而引起的后果，亦使得原本实力就不强劲的鲁王政权，内部也发生了分裂。
唐、鲁两个政权，都以反清复明为宗旨，但此时却因为争夺正统之位，严重削弱了抗击清军的实力。
九月中旬，鲁王朱以海见朝臣分裂，其中不少人主张尊奉隆武帝，心中十分不快，随宣布退归藩位，返回台州。
九月底，主张承认隆武朝廷为正统的大臣，开读了诏书，但在国舅张国俊、督师熊汝霖等人的反对下，最终拒绝了接受隆武政权的诏书，重新迎回朱以海。
不久后，唐鲁纷争中，隆武朝的都御史陆清源被鲁王部将所杀后，隆武帝也将鲁监国的使者陈谦斩杀，使得福建与浙东的关系彻底恶化。
唐、鲁争立，使得南明的两个重要政权，走向对立，唐、鲁之争从此愈演愈烈。
鲁王和忠于他的大臣都很明白，仅凭浙东之地，无法与隆武争位，为了尽早确定名分，随决议大起浙东之兵，先克杭州，再复金陵，先拜孝陵，建立远超隆武朝廷的威望，以复南都的功绩，来登基称帝。
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