但是考虑到实情，朱翊钧也做出了部分让步。
乌斯藏与青海，成立宣政使司，名字跟布政使司差一字，职权差不多，只是僧俗全管。
乌斯藏地区直接设县，一个县的面积可能比浙江还要大。部落首领改授世袭武职，百户、千户、指挥使佥事、指挥使，以示恩赐，笼络人心。
然后部落民众援蒙古例，改编成小旗、中旗、百户。
部落首领们担任小旗官、中旗官和百户，拥有一定的管理权，类似村长、乡长，但是必须接受知县、县丞、县尉和主簿组成的县政事府管理。
县政事府直接由乌斯藏宣政府管理。
当然了，边境地区如哲域（锡金）、主域（不丹）、门域和落域（藏南地区）、扎布兰（扎达）、普兰、思达藏（吉隆）等地成立千户所，实行军屯制，归兵备使司管。
部分是常备战兵，承担日常巡逻和战备。
大部分是屯垦辅兵，种地放牧，定期军事训练，到了危急时刻摇身一变成为军队。
三王、三法王为首的僧侣集团，必须教俗分离。各大教院僧侣有定额，必须在乌斯藏宣政使司礼曹注册登记，接受考核，合格者颁发度牒。
僧侣被授予善世、阐教、讲经、觉义头衔，享受正六、从六、正八、从八品官阶待遇。
教院名下不得有田地、牧场和部众，此前拥有的全部剥离出来，划归到宣政使司名下。教院修缮、僧侣生活用度，全部由宣政使司拨付钱粮。
听完使节送达的朝廷条件，乌斯藏的僧俗群体当时就炸了。
我们这些头人首领，以前是都指挥使、是元帅、是万户、指挥使、千户，现在居然被降级为小旗、中旗和百户，缩水缩得太离谱了吧！
你们打发叫花子吗？
我们这些僧人，以前都被封王和法王，现在就给个善世、阐教等六八品官阶头衔。你是在埋汰谁呢？
还有，每家佛院僧侣数量有定额，必须考试和领取度牒。名分和钱粮全捏在你们手里，岂不是要跪着讨饭吃？
我们可是佛祖的代言人，只跪佛祖，岂能跪尔等凡人！
不答应，坚决不能答应这样耻辱的条件。
既然道理讲不通，那就讲物理！
朱翊钧一声令下，万历三年春夏之际，青海的蒙古翼卫军出动四个骑兵团，分两路直奔拉萨、曲水和沙鲁（日喀则）、萨加、思达藏。
克城寨十七座，斩首两千一百人，
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